Protein–RNA interactions for Protein: P23979

Htr3a, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3aP23979 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htr3aP23979 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms