Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gria1P23818 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gria1P23818 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gria1P23818 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gria1P23818 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gria1P23818 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gria1P23818 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gria1P23818 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms