Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm8858-201ENSMUST00000118259 342 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm15780-201ENSMUST00000121283 935 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Mir1898-201ENSMUST00000122643 83 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm37214-201ENSMUST00000192860 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm43903-201ENSMUST00000205126 617 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Olfr815-201ENSMUST00000071557 951 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 AC107757.2-201ENSMUST00000226370 1466 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Olfr1073-ps1-201ENSMUST00000117635 381 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Apela-201ENSMUST00000124790 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm17219-201ENSMUST00000168439 593 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Vmn1r14-201ENSMUST00000177435 912 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Igkv13-62-1-201ENSMUST00000198690 317 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Olfr805-201ENSMUST00000078876 960 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm10029-201ENSMUST00000089635 330 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm22906-201ENSMUST00000175191 250 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm21045-201ENSMUST00000183058 1020 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Znrd1as-204ENSMUST00000209623 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 AL645546.2-201ENSMUST00000224526 265 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Olfr1280-201ENSMUST00000082167 1003 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Olfr490-201ENSMUST00000210114 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm23448-201ENSMUST00000083151 104 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxd11P23813 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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