Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms