Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkchP23298 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkchP23298 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkchP23298 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkchP23298 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkchP23298 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkchP23298 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkchP23298 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkchP23298 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkchP23298 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkchP23298 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkchP23298 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkchP23298 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkchP23298 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkchP23298 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkchP23298 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkchP23298 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkchP23298 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkchP23298 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkchP23298 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkchP23298 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkchP23298 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkchP23298 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkchP23298 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkchP23298 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkchP23298 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkchP23298 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkchP23298 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkchP23298 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms