Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PparaP23204 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PparaP23204 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PparaP23204 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PparaP23204 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PparaP23204 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PparaP23204 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PparaP23204 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PparaP23204 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PparaP23204 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PparaP23204 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PparaP23204 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PparaP23204 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PparaP23204 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PparaP23204 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PparaP23204 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PparaP23204 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PparaP23204 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PparaP23204 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PparaP23204 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PparaP23204 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PparaP23204 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PparaP23204 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PparaP23204 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PparaP23204 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PparaP23204 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PparaP23204 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PparaP23204 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PparaP23204 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PparaP23204 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PparaP23204 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PparaP23204 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PparaP23204 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PparaP23204 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PparaP23204 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PparaP23204 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PparaP23204 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PparaP23204 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PparaP23204 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PparaP23204 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PparaP23204 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PparaP23204 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PparaP23204 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PparaP23204 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PparaP23204 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PparaP23204 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PparaP23204 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PparaP23204 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PparaP23204 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PparaP23204 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PparaP23204 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PparaP23204 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PparaP23204 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PparaP23204 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PparaP23204 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PparaP23204 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PparaP23204 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PparaP23204 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PparaP23204 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PparaP23204 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PparaP23204 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PparaP23204 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PparaP23204 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PparaP23204 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PparaP23204 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PparaP23204 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PparaP23204 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PparaP23204 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PparaP23204 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PparaP23204 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PparaP23204 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PparaP23204 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PparaP23204 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PparaP23204 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PparaP23204 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PparaP23204 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PparaP23204 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PparaP23204 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PparaP23204 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PparaP23204 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PparaP23204 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PparaP23204 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PparaP23204 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PparaP23204 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PparaP23204 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PparaP23204 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PparaP23204 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PparaP23204 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PparaP23204 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PparaP23204 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PparaP23204 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PparaP23204 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PparaP23204 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PparaP23204 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PparaP23204 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PparaP23204 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PparaP23204 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PparaP23204 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PparaP23204 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PparaP23204 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms