Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tap1P21958 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tap1P21958 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tap1P21958 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tap1P21958 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tap1P21958 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tap1P21958 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tap1P21958 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tap1P21958 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tap1P21958 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms