Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnc2P20801 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnc2P20801 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnc2P20801 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnc2P20801 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnc2P20801 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc2P20801 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc2P20801 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc2P20801 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc2P20801 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc2P20801 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc2P20801 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc2P20801 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc2P20801 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc2P20801 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc2P20801 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc2P20801 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc2P20801 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc2P20801 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc2P20801 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc2P20801 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc2P20801 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc2P20801 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc2P20801 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc2P20801 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc2P20801 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc2P20801 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc2P20801 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc2P20801 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc2P20801 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc2P20801 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc2P20801 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc2P20801 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc2P20801 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc2P20801 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Tnnc2P20801 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tnnc2P20801 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnc2P20801 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms