Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TP20293 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TP20293 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TP20293 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TP20293 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TP20293 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TP20293 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TP20293 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TP20293 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TP20293 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TP20293 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TP20293 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TP20293 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TP20293 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TP20293 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TP20293 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TP20293 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TP20293 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TP20293 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TP20293 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TP20293 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TP20293 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TP20293 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TP20293 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TP20293 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TP20293 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TP20293 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TP20293 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TP20293 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TP20293 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TP20293 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TP20293 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TP20293 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TP20293 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TP20293 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TP20293 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TP20293 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TP20293 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TP20293 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TP20293 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TP20293 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TP20293 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TP20293 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TP20293 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TP20293 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TP20293 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TP20293 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TP20293 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TP20293 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TP20293 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TP20293 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TP20293 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TP20293 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TP20293 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TP20293 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TP20293 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TP20293 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TP20293 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TP20293 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TP20293 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TP20293 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TP20293 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TP20293 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TP20293 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TP20293 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TP20293 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TP20293 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TP20293 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TP20293 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TP20293 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TP20293 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TP20293 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TP20293 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TP20293 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TP20293 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TP20293 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TP20293 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TP20293 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TP20293 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TP20293 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TP20293 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TP20293 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TP20293 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TP20293 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TP20293 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TP20293 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TP20293 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TP20293 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TP20293 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TP20293 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TP20293 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TP20293 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TP20293 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TP20293 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TP20293 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TP20293 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TP20293 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TP20293 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TP20293 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TP20293 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms