Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VimP20152 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VimP20152 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VimP20152 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VimP20152 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VimP20152 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VimP20152 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VimP20152 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VimP20152 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VimP20152 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VimP20152 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VimP20152 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VimP20152 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VimP20152 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VimP20152 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VimP20152 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VimP20152 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VimP20152 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VimP20152 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VimP20152 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VimP20152 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VimP20152 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VimP20152 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VimP20152 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VimP20152 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VimP20152 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VimP20152 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VimP20152 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VimP20152 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VimP20152 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VimP20152 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VimP20152 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VimP20152 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VimP20152 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VimP20152 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VimP20152 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VimP20152 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VimP20152 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VimP20152 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VimP20152 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VimP20152 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VimP20152 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VimP20152 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VimP20152 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VimP20152 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VimP20152 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VimP20152 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VimP20152 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VimP20152 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VimP20152 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VimP20152 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VimP20152 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VimP20152 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VimP20152 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VimP20152 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VimP20152 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VimP20152 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VimP20152 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VimP20152 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VimP20152 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VimP20152 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VimP20152 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VimP20152 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VimP20152 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VimP20152 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VimP20152 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VimP20152 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VimP20152 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VimP20152 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VimP20152 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VimP20152 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VimP20152 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VimP20152 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VimP20152 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VimP20152 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VimP20152 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VimP20152 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VimP20152 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VimP20152 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VimP20152 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VimP20152 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VimP20152 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VimP20152 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VimP20152 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VimP20152 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VimP20152 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VimP20152 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VimP20152 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VimP20152 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VimP20152 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VimP20152 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VimP20152 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VimP20152 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VimP20152 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VimP20152 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VimP20152 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VimP20152 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VimP20152 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VimP20152 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VimP20152 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms