Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms