Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18529 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18529 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18529 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18529 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18529 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18529 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18529 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P18529 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P18529 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P18529 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18529 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18529 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18529 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18529 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18529 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18529 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18529 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18529 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18529 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18529 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18529 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P18529 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18529 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18529 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18529 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18529 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18529 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18529 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18529 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18529 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18529 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18529 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18529 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18529 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18529 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18529 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18529 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18529 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18529 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18529 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18529 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18529 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18529 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18529 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18529 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18529 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18529 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18529 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18529 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18529 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18529 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18529 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18529 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18529 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18529 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18529 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18529 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
P18529 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18529 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18529 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18529 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18529 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18529 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18529 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18529 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18529 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18529 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18529 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18529 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18529 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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P18529 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18529 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
P18529 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18529 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18529 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18529 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18529 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18529 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18529 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18529 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18529 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18529 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18529 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18529 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18529 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18529 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18529 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18529 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18529 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P18529 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P18529 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18529 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18529 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18529 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18529 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18529 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P18529 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
P18529 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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