Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsdP18242 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsdP18242 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsdP18242 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsdP18242 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsdP18242 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsdP18242 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsdP18242 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsdP18242 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsdP18242 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms