Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f1P17208 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms