Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sptan1P16546 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sptan1P16546 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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