Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp53P15975 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp53P15975 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp53P15975 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp53P15975 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp53P15975 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp53P15975 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp53P15975 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp53P15975 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp53P15975 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp53P15975 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms