Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54P14576 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54P14576 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Srp54P14576 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srp54P14576 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54P14576 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Srp54P14576 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54P14576 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp54P14576 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srp54P14576 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms