Protein–RNA interactions for Protein: P13405

Rb1, Retinoblastoma-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1P13405 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rb1P13405 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rb1P13405 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rb1P13405 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rb1P13405 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rb1P13405 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rb1P13405 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rb1P13405 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms