Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nr4a1P12813 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nr4a1P12813 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms