Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb1P12658 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Calb1P12658 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Calb1P12658 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Calb1P12658 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb1P12658 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb1P12658 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb1P12658 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb1P12658 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Calb1P12658 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Calb1P12658 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Calb1P12658 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms