Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa1P11477 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa1P11477 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa1P11477 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa1P11477 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa1P11477 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa1P11477 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa1P11477 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa1P11477 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms