Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P10404 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P10404 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P10404 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P10404 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P10404 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P10404 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P10404 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P10404 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P10404 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P10404 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P10404 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P10404 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P10404 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P10404 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P10404 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P10404 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P10404 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P10404 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P10404 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P10404 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P10404 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P10404 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P10404 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P10404 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P10404 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P10404 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P10404 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P10404 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P10404 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P10404 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P10404 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P10404 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P10404 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P10404 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P10404 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P10404 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P10404 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P10404 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P10404 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P10404 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P10404 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P10404 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P10404 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P10404 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P10404 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P10404 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P10404 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P10404 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P10404 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P10404 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P10404 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P10404 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P10404 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P10404 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P10404 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P10404 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P10404 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
P10404 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P10404 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P10404 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P10404 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P10404 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P10404 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P10404 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P10404 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P10404 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P10404 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P10404 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P10404 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P10404 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
P10404 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P10404 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P10404 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P10404 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P10404 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P10404 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P10404 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P10404 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P10404 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P10404 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P10404 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P10404 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P10404 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P10404 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P10404 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P10404 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P10404 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P10404 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P10404 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P10404 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P10404 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P10404 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P10404 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P10404 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P10404 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P10404 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P10404 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P10404 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P10404 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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