Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Schip1P0DPB4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms