Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnmt3cP0DOY1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dnmt3cP0DOY1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms