Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UbbP0CG49 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
UbbP0CG49 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms