Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb1P09055 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms