Protein–RNA interactions for Protein: P01851

T-cell receptor beta-2 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01851 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01851 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01851 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01851 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01851 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01851 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01851 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01851 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01851 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01851 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01851 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01851 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01851 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01851 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01851 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01851 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01851 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01851 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01851 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01851 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01851 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01851 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01851 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01851 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01851 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01851 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01851 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01851 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01851 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01851 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01851 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01851 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01851 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01851 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01851 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01851 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01851 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01851 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01851 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01851 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01851 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01851 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01851 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01851 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01851 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01851 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01851 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01851 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01851 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01851 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01851 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01851 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01851 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01851 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01851 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01851 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01851 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01851 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01851 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01851 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01851 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01851 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01851 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01851 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01851 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01851 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01851 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01851 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01851 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01851 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01851 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01851 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01851 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01851 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01851 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01851 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01851 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01851 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01851 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01851 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01851 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01851 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01851 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01851 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01851 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01851 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01851 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01851 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01851 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01851 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01851 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01851 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01851 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01851 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01851 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01851 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01851 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01851 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01851 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P01851 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms