Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01740 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01740 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01740 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01740 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01740 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01740 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01740 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01740 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01740 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01740 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01740 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01740 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01740 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01740 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01740 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01740 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01740 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01740 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01740 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01740 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01740 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01740 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01740 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01740 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01740 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01740 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01740 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01740 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01740 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01740 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01740 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01740 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01740 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01740 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01740 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01740 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01740 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01740 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01740 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01740 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01740 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01740 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01740 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01740 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01740 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01740 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01740 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01740 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01740 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01740 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01740 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01740 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01740 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01740 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01740 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01740 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01740 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01740 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01740 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01740 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01740 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01740 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01740 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01740 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01740 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01740 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01740 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01740 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01740 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01740 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01740 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01740 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01740 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01740 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01740 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01740 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01740 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01740 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01740 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01740 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01740 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01740 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01740 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01740 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01740 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01740 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01740 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01740 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01740 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01740 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01740 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01740 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01740 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01740 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01740 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01740 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01740 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01740 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01740 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms