Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01679 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01679 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01679 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01679 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01679 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01679 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01679 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01679 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01679 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01679 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01679 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01679 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01679 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01679 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01679 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01679 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01679 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01679 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01679 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01679 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01679 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01679 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01679 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01679 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01679 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01679 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01679 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01679 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01679 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01679 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01679 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01679 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01679 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01679 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01679 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01679 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01679 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01679 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01679 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01679 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01679 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01679 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01679 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01679 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01679 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01679 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01679 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01679 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01679 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01679 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01679 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01679 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01679 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01679 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01679 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01679 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01679 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01679 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01679 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01679 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01679 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01679 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01679 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01679 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01679 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01679 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01679 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01679 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01679 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01679 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01679 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01679 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01679 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01679 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01679 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01679 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01679 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01679 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01679 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01679 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01679 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01679 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01679 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01679 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01679 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01679 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01679 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01679 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01679 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01679 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01679 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01679 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01679 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01679 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01679 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01679 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01679 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01679 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01679 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms