Protein–RNA interactions for Protein: P01669

Ig kappa chain V-III region PC 7769, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01669 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01669 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01669 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01669 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01669 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01669 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01669 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01669 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01669 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01669 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01669 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01669 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01669 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01669 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01669 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01669 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01669 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01669 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01669 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01669 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01669 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01669 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01669 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01669 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01669 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01669 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01669 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01669 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01669 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01669 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01669 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01669 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01669 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01669 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01669 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01669 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01669 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01669 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01669 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01669 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01669 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01669 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01669 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01669 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01669 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01669 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01669 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01669 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01669 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01669 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01669 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01669 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01669 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01669 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01669 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01669 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01669 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01669 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01669 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01669 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01669 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01669 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01669 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01669 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01669 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01669 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01669 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01669 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01669 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01669 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01669 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01669 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01669 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01669 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01669 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01669 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01669 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01669 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01669 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01669 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01669 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01669 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01669 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01669 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01669 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01669 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01669 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01669 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01669 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01669 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01669 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01669 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01669 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01669 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01669 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01669 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01669 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01669 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01669 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01669 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms