Protein–RNA interactions for Protein: P01644

Ig kappa chain V-V region HP R16.7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01644 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01644 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01644 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01644 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01644 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01644 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01644 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01644 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01644 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01644 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01644 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01644 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P01644 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01644 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01644 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P01644 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01644 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P01644 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P01644 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01644 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01644 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01644 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01644 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01644 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01644 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01644 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01644 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01644 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01644 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01644 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
P01644 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01644 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P01644 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01644 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P01644 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01644 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01644 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01644 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01644 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01644 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P01644 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01644 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01644 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01644 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01644 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01644 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01644 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01644 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01644 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01644 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01644 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01644 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01644 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01644 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01644 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01644 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01644 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01644 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01644 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01644 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01644 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01644 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01644 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01644 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01644 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01644 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P01644 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01644 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P01644 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01644 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01644 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P01644 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P01644 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01644 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01644 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P01644 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01644 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01644 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01644 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01644 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01644 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P01644 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01644 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01644 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01644 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01644 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01644 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01644 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01644 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01644 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01644 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01644 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01644 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01644 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01644 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01644 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01644 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01644 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01644 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P01644 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms