Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EGFRP00533 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EGFRP00533 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EGFRP00533 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EGFRP00533 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EGFRP00533 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EGFRP00533 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EGFRP00533 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EGFRP00533 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EGFRP00533 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EGFRP00533 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EGFRP00533 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EGFRP00533 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EGFRP00533 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EGFRP00533 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EGFRP00533 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EGFRP00533 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EGFRP00533 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EGFRP00533 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EGFRP00533 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EGFRP00533 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EGFRP00533 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EGFRP00533 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EGFRP00533 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EGFRP00533 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EGFRP00533 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EGFRP00533 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EGFRP00533 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EGFRP00533 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EGFRP00533 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EGFRP00533 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EGFRP00533 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EGFRP00533 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EGFRP00533 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EGFRP00533 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EGFRP00533 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EGFRP00533 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGFRP00533 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGFRP00533 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGFRP00533 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGFRP00533 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGFRP00533 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGFRP00533 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGFRP00533 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGFRP00533 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGFRP00533 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGFRP00533 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGFRP00533 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EGFRP00533 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EGFRP00533 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGFRP00533 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGFRP00533 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EGFRP00533 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGFRP00533 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGFRP00533 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGFRP00533 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EGFRP00533 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGFRP00533 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGFRP00533 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGFRP00533 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGFRP00533 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGFRP00533 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGFRP00533 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGFRP00533 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EGFRP00533 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGFRP00533 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGFRP00533 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EGFRP00533 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGFRP00533 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGFRP00533 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGFRP00533 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGFRP00533 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGFRP00533 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EGFRP00533 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGFRP00533 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGFRP00533 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGFRP00533 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGFRP00533 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGFRP00533 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGFRP00533 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGFRP00533 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGFRP00533 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGFRP00533 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGFRP00533 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGFRP00533 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EGFRP00533 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGFRP00533 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGFRP00533 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGFRP00533 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGFRP00533 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGFRP00533 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGFRP00533 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EGFRP00533 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGFRP00533 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGFRP00533 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGFRP00533 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EGFRP00533 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGFRP00533 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGFRP00533 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGFRP00533 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms