Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp1O89090 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp1O89090 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp1O89090 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp1O89090 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp1O89090 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp1O89090 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp1O89090 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp1O89090 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sp1O89090 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sp1O89090 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sp1O89090 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sp1O89090 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sp1O89090 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sp1O89090 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sp1O89090 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sp1O89090 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms