Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BlmO88700 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BlmO88700 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BlmO88700 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BlmO88700 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BlmO88700 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BlmO88700 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BlmO88700 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BlmO88700 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BlmO88700 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BlmO88700 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BlmO88700 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BlmO88700 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BlmO88700 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BlmO88700 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BlmO88700 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BlmO88700 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BlmO88700 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BlmO88700 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BlmO88700 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BlmO88700 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BlmO88700 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BlmO88700 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BlmO88700 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BlmO88700 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BlmO88700 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BlmO88700 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BlmO88700 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BlmO88700 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BlmO88700 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BlmO88700 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BlmO88700 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BlmO88700 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BlmO88700 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BlmO88700 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BlmO88700 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BlmO88700 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BlmO88700 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BlmO88700 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BlmO88700 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BlmO88700 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BlmO88700 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BlmO88700 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BlmO88700 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BlmO88700 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BlmO88700 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BlmO88700 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BlmO88700 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BlmO88700 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BlmO88700 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BlmO88700 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BlmO88700 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BlmO88700 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BlmO88700 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BlmO88700 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BlmO88700 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BlmO88700 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BlmO88700 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BlmO88700 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BlmO88700 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BlmO88700 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BlmO88700 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BlmO88700 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BlmO88700 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BlmO88700 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BlmO88700 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BlmO88700 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BlmO88700 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BlmO88700 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BlmO88700 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BlmO88700 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BlmO88700 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BlmO88700 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BlmO88700 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BlmO88700 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BlmO88700 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BlmO88700 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BlmO88700 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BlmO88700 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BlmO88700 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BlmO88700 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BlmO88700 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BlmO88700 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BlmO88700 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BlmO88700 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BlmO88700 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BlmO88700 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BlmO88700 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BlmO88700 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BlmO88700 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BlmO88700 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BlmO88700 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BlmO88700 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BlmO88700 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BlmO88700 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BlmO88700 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BlmO88700 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BlmO88700 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BlmO88700 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BlmO88700 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms