Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3bO88509 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms