Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CntfrO88507 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CntfrO88507 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CntfrO88507 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CntfrO88507 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CntfrO88507 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CntfrO88507 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CntfrO88507 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CntfrO88507 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntfrO88507 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntfrO88507 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntfrO88507 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms