Protein–RNA interactions for Protein: O88454

Kcnk4, Potassium channel subfamily K member 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk4O88454 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms