Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AurkcO88445 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AurkcO88445 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkcO88445 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkcO88445 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AurkcO88445 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AurkcO88445 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms