Protein–RNA interactions for Protein: O88200

Clec11a, C-type lectin domain family 11 member A, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec11aO88200 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clec11aO88200 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clec11aO88200 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clec11aO88200 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clec11aO88200 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clec11aO88200 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clec11aO88200 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clec11aO88200 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms