Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xirp1O70373 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms