Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nptx2O70340 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms