Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RngttO55236 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RngttO55236 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RngttO55236 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RngttO55236 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RngttO55236 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RngttO55236 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RngttO55236 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RngttO55236 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RngttO55236 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RngttO55236 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RngttO55236 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RngttO55236 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RngttO55236 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RngttO55236 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RngttO55236 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RngttO55236 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RngttO55236 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RngttO55236 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RngttO55236 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RngttO55236 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RngttO55236 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RngttO55236 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RngttO55236 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RngttO55236 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RngttO55236 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RngttO55236 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RngttO55236 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RngttO55236 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RngttO55236 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RngttO55236 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RngttO55236 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RngttO55236 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RngttO55236 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RngttO55236 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RngttO55236 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RngttO55236 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RngttO55236 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RngttO55236 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RngttO55236 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RngttO55236 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RngttO55236 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RngttO55236 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RngttO55236 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RngttO55236 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RngttO55236 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RngttO55236 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RngttO55236 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RngttO55236 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RngttO55236 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RngttO55236 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RngttO55236 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RngttO55236 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RngttO55236 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RngttO55236 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RngttO55236 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RngttO55236 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RngttO55236 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RngttO55236 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RngttO55236 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RngttO55236 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RngttO55236 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RngttO55236 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RngttO55236 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RngttO55236 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RngttO55236 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RngttO55236 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RngttO55236 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RngttO55236 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RngttO55236 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RngttO55236 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RngttO55236 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RngttO55236 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RngttO55236 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RngttO55236 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RngttO55236 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RngttO55236 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RngttO55236 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RngttO55236 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RngttO55236 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RngttO55236 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RngttO55236 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RngttO55236 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RngttO55236 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RngttO55236 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RngttO55236 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RngttO55236 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RngttO55236 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RngttO55236 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RngttO55236 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RngttO55236 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RngttO55236 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RngttO55236 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RngttO55236 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RngttO55236 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RngttO55236 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RngttO55236 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RngttO55236 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RngttO55236 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RngttO55236 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms