Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ldb2O55203 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ldb2O55203 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ldb2O55203 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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