Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx4O55187 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx4O55187 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms