Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syngr1O55100 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms