Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb2O55029 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb2O55029 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb2O55029 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb2O55029 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb2O55029 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Copb2O55029 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb2O55029 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb2O55029 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb2O55029 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Copb2O55029 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms