Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdkO55028 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdkO55028 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdkO55028 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdkO55028 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdkO55028 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdkO55028 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BckdkO55028 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdkO55028 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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