Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SlkO54988 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SlkO54988 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SlkO54988 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SlkO54988 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SlkO54988 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SlkO54988 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SlkO54988 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SlkO54988 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SlkO54988 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SlkO54988 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SlkO54988 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SlkO54988 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SlkO54988 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SlkO54988 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SlkO54988 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SlkO54988 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SlkO54988 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SlkO54988 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SlkO54988 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SlkO54988 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SlkO54988 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SlkO54988 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SlkO54988 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SlkO54988 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SlkO54988 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SlkO54988 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SlkO54988 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SlkO54988 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SlkO54988 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SlkO54988 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SlkO54988 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SlkO54988 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SlkO54988 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SlkO54988 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SlkO54988 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SlkO54988 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SlkO54988 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SlkO54988 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SlkO54988 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SlkO54988 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SlkO54988 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SlkO54988 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SlkO54988 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SlkO54988 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SlkO54988 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SlkO54988 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SlkO54988 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SlkO54988 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SlkO54988 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SlkO54988 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SlkO54988 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SlkO54988 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SlkO54988 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SlkO54988 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SlkO54988 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SlkO54988 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SlkO54988 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SlkO54988 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SlkO54988 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SlkO54988 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SlkO54988 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SlkO54988 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SlkO54988 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SlkO54988 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SlkO54988 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SlkO54988 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SlkO54988 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SlkO54988 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SlkO54988 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SlkO54988 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SlkO54988 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SlkO54988 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SlkO54988 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SlkO54988 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SlkO54988 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SlkO54988 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SlkO54988 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SlkO54988 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SlkO54988 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SlkO54988 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SlkO54988 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SlkO54988 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SlkO54988 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SlkO54988 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SlkO54988 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SlkO54988 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SlkO54988 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SlkO54988 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SlkO54988 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SlkO54988 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SlkO54988 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SlkO54988 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SlkO54988 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SlkO54988 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SlkO54988 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SlkO54988 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SlkO54988 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SlkO54988 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SlkO54988 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms