Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema6bO54951 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema6bO54951 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema6bO54951 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema6bO54951 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema6bO54951 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema6bO54951 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema6bO54951 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema6bO54951 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema6bO54951 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema6bO54951 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema6bO54951 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema6bO54951 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema6bO54951 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema6bO54951 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema6bO54951 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema6bO54951 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema6bO54951 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema6bO54951 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema6bO54951 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema6bO54951 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema6bO54951 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema6bO54951 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema6bO54951 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema6bO54951 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema6bO54951 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema6bO54951 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema6bO54951 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema6bO54951 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema6bO54951 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema6bO54951 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema6bO54951 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema6bO54951 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema6bO54951 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema6bO54951 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema6bO54951 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema6bO54951 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema6bO54951 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema6bO54951 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema6bO54951 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema6bO54951 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema6bO54951 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms