Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Itgb3O54890 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms